cDNA cloning and transcriptional controlling of a novel low dose radiation-induced gene and its function analysis
周平坤, 隋建丽
Abstract
周平坤, 隋建丽
Abstract
目的克隆低剂量辐射诱导基因,研究辐射对其转录调控作用和生物学功能.方法用mRNA差异显示技术分离辐射诱导表达基因,用RACE技术获取cDNA旁侧序列,Northern杂交分析基因的转录调节,生物信息学分析基因的结构和功能.结果获得包括3'端在内的辐射诱导新基因LRIGx的cDNA片段,序列同源性比较显示与人染色体20q11.2-12一段DNA高度同源(>99%).Northern杂交结果揭示该基因转录子全长约8.5 kb,在0.2 Gy照射后2 h出现诱导表达,4 h后转录子水平为对照细胞的5倍多,也受0.02 Gy更低剂量照射诱导表达.2 Gy大剂量照射后1 h出现短暂诱导表达,但不如低剂量照射明显,2 h后恢复正常水平.生物信息学分析结果显示该基因编码产物含有解旋酶活性保守区.结论分离鉴定出一低剂量辐射反应基因,其编码蛋白可能参与DNA代谢(如修复)等细胞辐射反应过程.
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目的克隆低剂量辐射诱导基因,研究辐射对其转录调控作用和生物学功能.方法用mRNA差异显示技术分离辐射诱导表达基因,用RACE技术获取cDNA旁侧序列,Northern杂交分析基因的转录调节,生物信息学分析基因的结构和功能.结果获得包括3'端在内的辐射诱导新基因LRIGx的cDNA片段,序列同源性比较显示与人染色体20q11.2-12一段DNA高度同源(>99%).Northern杂交结果揭示该基因转录子全长约8.5 kb,在0.2 Gy照射后2 h出现诱导表达,4 h后转录子水平为对照细胞的5倍多,也受0.02 Gy更低剂量照射诱导表达.2 Gy大剂量照射后1 h出现短暂诱导表达,但不如低剂量照射明显,2 h后恢复正常水平.生物信息学分析结果显示该基因编码产物含有解旋酶活性保守区.结论分离鉴定出一低剂量辐射反应基因,其编码蛋白可能参与DNA代谢(如修复)等细胞辐射反应过程.
Key concepts: Cloning (programming), Complementary DNA, Gene, Function (biology), Genetics, Biology, Computational biology, Gene expression