Nematode Diversity of Qingdao Coast Inferred from the 18S Ribosomal RNA Gene Sequence Analysis
Shen, Xiquan, Yang, Guanpin, Liu, Yongjian
Abstract
Shen, Xiquan, Yang, Guanpin, Liu, Yongjian
Abstract
18S ribosomal DNA 基因(18S rDNA ) 序列(近似在长度的 1300bp ) 从从与线虫大批从 Qingdao 海岸的内部潮汐的沉积收集的免费生活的海洋的线虫提取的 DNA 被放大特定的教材。PCR 产品被克隆,重新放大,与 Rsa 消化了我和 Hin6 我限制 endonucleases 和分开的 inagarose 胶化。在 17 种限制碎片长度类型之中,打 1, 2 和 6 盖住 61.2% ,分别地,当时,克隆的 14.4%and9.3% 分析了留下 14 仅仅盖住 21 克隆,它说明了 15.1% 总数。24 代表性的克隆 andphylogenetically 被定序由指在 RDP 和 GenBank 数据库当前可得到的那些分析了。尽管它是难的由于已知的海洋的免费生活的线虫的 18SrDNA 顺序数据的缺乏把这些序列分到已知的种类或类,获得的序列被分到 Adenophorea 的线虫。在他们之中, 12 个序列接近了 Pontonema vulgare andAdoncholaimus sp,四到 Daptonema procerus 并且二(相同) 到 Enoplus brevis。我们的结果证明免费生活的海洋的线虫差异能被检索的 PCR 决定, 18S rDNA 的分析定序,仅当免费生活的海洋的线虫的 18S rDNA 序列被积累到某程度,一个 18S rDNA 序列能被分到种或一个类。
A significance statement is not available in the OpenAlex record.
A contribution statement is not available in the OpenAlex record.
Method details are not available in the OpenAlex metadata.
Findings are not separately available in the OpenAlex metadata.
Limitations are not available in the OpenAlex metadata.
Application details are not available in the OpenAlex metadata.
18S ribosomal DNA 基因(18S rDNA ) 序列(近似在长度的 1300bp ) 从从与线虫大批从 Qingdao 海岸的内部潮汐的沉积收集的免费生活的海洋的线虫提取的 DNA 被放大特定的教材。PCR 产品被克隆,重新放大,与 Rsa 消化了我和 Hin6 我限制 endonucleases 和分开的 inagarose 胶化。在 17 种限制碎片长度类型之中,打 1, 2 和 6 盖住 61.2% ,分别地,当时,克隆的 14.4%and9.3% 分析了留下 14 仅仅盖住 21 克隆,它说明了 15.1% 总数。24 代表性的克隆 andphylogenetically 被定序由指在 RDP 和 GenBank 数据库当前可得到的那些分析了。尽管它是难的由于已知的海洋的免费生活的线虫的 18SrDNA 顺序数据的缺乏把这些序列分到已知的种类或类,获得的序列被分到 Adenophorea 的线虫。在他们之中, 12 个序列接近了 Pontonema vulgare andAdoncholaimus sp,四到 Daptonema procerus 并且二(相同) 到 Enoplus brevis。我们的结果证明免费生活的海洋的线虫差异能被检索的 PCR 决定, 18S rDNA 的分析定序,仅当免费生活的海洋的线虫的 18S rDNA 序列被积累到某程度,一个 18S rDNA 序列能被分到种或一个类。
Key concepts: 18S ribosomal RNA, Ribosomal DNA, GenBank, Biology, Ribosomal RNA, Gene, Genetics, Molecular biology