A snapshot on spatial and vertical distribution of bacterial communities in the eastern Indian Ocean
Wang, Jing Jing, Kan Kan, Jinjun, Borecki, Laura, Zhang, Xiaodong, Dongxiao, Сун, Jun Jun
Abstract
Wang, Jing Jing, Kan Kan, Jinjun, Borecki, Laura, Zhang, Xiaodong, Dongxiao, Сун, Jun Jun
Abstract
除是海洋的食物网的批评部件以外,微生物在在海洋营养素和元素骑车的 biogeochemical 起重要作用。当前,很少在东方印度洋对微生物引起的人口结构和他们的分布被知道。在这研究,我们包括聚合酶链反应变性剂坡度胶化电气泳动(PCR-DGGE ) 和定序在东方印度洋从赤道的区域和孟加拉的邻近的海湾调查细菌的 16S rRNA 基因的高产量的下一代使用了分子的途径。一般来说, Bacteroidetes, Proteobacteria (主要 Alpha,和 Gamma ) , Actinobacteria, Cyanobacteria 和 Planctomycetes 统治了微生物引起的社区。主要的微生物引起的组的水平地不同的空间分发从 PCR-DGGE 胶化图象分析被观察。然而,由 pyrosequencing 的社区结构的进一步的详细描述建议了一个更显著的成层的分发模式:Cyanobacteria 和 Actinobacteria 在表面水(25 m ) 是更占优势的;当时,在 25 m 和 150 m 统治的 Bacteroidetes Proteobacteria (主要 Alphaproteobacteria ) 更经常发生在 75 m 水深度。与增加水深度,从不同地点的细菌的社区趋于分享高类似,显示为细菌的次要的组划分的一个壁龛与定序途径的高产量恢复了。这研究在东方印度洋在水列在生物多样性和细菌的空间分发上提供了第一张快照,并且调查结果进一步在在东方印度洋骑车的精力和资源强调了这些微生物的潜在的功能的角色。
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除是海洋的食物网的批评部件以外,微生物在在海洋营养素和元素骑车的 biogeochemical 起重要作用。当前,很少在东方印度洋对微生物引起的人口结构和他们的分布被知道。在这研究,我们包括聚合酶链反应变性剂坡度胶化电气泳动(PCR-DGGE ) 和定序在东方印度洋从赤道的区域和孟加拉的邻近的海湾调查细菌的 16S rRNA 基因的高产量的下一代使用了分子的途径。一般来说, Bacteroidetes, Proteobacteria (主要 Alpha,和 Gamma ) , Actinobacteria, Cyanobacteria 和 Planctomycetes 统治了微生物引起的社区。主要的微生物引起的组的水平地不同的空间分发从 PCR-DGGE 胶化图象分析被观察。然而,由 pyrosequencing 的社区结构的进一步的详细描述建议了一个更显著的成层的分发模式:Cyanobacteria 和 Actinobacteria 在表面水(25 m ) 是更占优势的;当时,在 25 m 和 150 m 统治的 Bacteroidetes Proteobacteria (主要 Alphaproteobacteria ) 更经常发生在 75 m 水深度。与增加水深度,从不同地点的细菌的社区趋于分享高类似,显示为细菌的次要的组划分的一个壁龛与定序途径的高产量恢复了。这研究在东方印度洋在水列在生物多样性和细菌的空间分发上提供了第一张快照,并且调查结果进一步在在东方印度洋骑车的精力和资源强调了这些微生物的潜在的功能的角色。
Key concepts: Bacteroidetes, Actinobacteria, Planctomycetes, Cyanobacteria, Alphaproteobacteria, Proteobacteria, Biogeochemical cycle, Biology