Effects of DNA extraction and universal primers on 16S rRNA gene-based DGGE analysis of a bacterial community from fish farming water

在与使中毒从环境样品调查微生物引起的差异的许多报告之中坡度胶化电气泳动(DGGE ) ，有限注意在 DGGE 分析的结果上被给了通用教材和 DNA 抽取的效果。在这研究，这些效果与从耕作水的一个细菌的社区上的基于基因的 DGGE 取样的 16S rRNA 被测试。结果显示在 DGGE 指纹的可辨别的乐队的数字不同，教材对使用了；63f/518r， 341f/926r 和 933f/1387r 教材对生产的乐队显然比由 968f/1401r 的那些是少数。另外，我们发现每个 DNA 抽取方法导致了不同社区侧面，在 DGGEfingerprint 由乐队的数字和紧张思考了。而且，主要乐队(理论上代表的主导的细菌) 与方法使用了的抽取不同。通用教材和 DNA 抽取的效果应该被给更多的注意并且小心地在与 DGGE 执行调查进新环境前选择，这因此被相信。