Polymorphism analysis of human cytomegalovirus UL148 gene in low passage clinical isolates
吉耀华, 阮强, 卢颖, 齐莹, 何蓉, 刘庆, 陈淑荣, 马艳萍
Abstract
吉耀华, 阮强, 卢颖, 齐莹, 何蓉, 刘庆, 陈淑荣, 马艳萍
Abstract
目的 研究人巨细胞病毒(HCMV)UL148序列在临床低传代分离株中的多态性.方法对38株经荧光定量PCR方法(Q-PCR)检测HCMV-DNA为阳性的临床低传代分离株的细胞培养上清液进行HCMV UL148全序列PCR扩增,并对PCR扩增产物进行序列测定及分析.结果38株临床低传代分离株有17株PCR扩增阳性,与HCMV Toledo株进行序列比较分析,17株临床分离株ULl48开放阅读框架(ORF)长度均与Toledo株相同.其编码蛋白的氨基酸变异率为0.3%~2.3%.所有分离株均有蛋白翻译后修饰位点的新增或缺失.与Toledo株相比17株临床分离株UL148蛋白质二级结构预测结果均为第15~18位之间由α-螺旋变为β-折叠.结论17株HCMV临床低传代分离株UL148基因及其编码产物的氨基酸序列比较保守,但仍存在一定程度的多态性。
A significance statement is not available in the OpenAlex record.
A contribution statement is not available in the OpenAlex record.
Method details are not available in the OpenAlex metadata.
Findings are not separately available in the OpenAlex metadata.
Limitations are not available in the OpenAlex metadata.
Application details are not available in the OpenAlex metadata.
目的 研究人巨细胞病毒(HCMV)UL148序列在临床低传代分离株中的多态性.方法对38株经荧光定量PCR方法(Q-PCR)检测HCMV-DNA为阳性的临床低传代分离株的细胞培养上清液进行HCMV UL148全序列PCR扩增,并对PCR扩增产物进行序列测定及分析.结果38株临床低传代分离株有17株PCR扩增阳性,与HCMV Toledo株进行序列比较分析,17株临床分离株ULl48开放阅读框架(ORF)长度均与Toledo株相同.其编码蛋白的氨基酸变异率为0.3%~2.3%.所有分离株均有蛋白翻译后修饰位点的新增或缺失.与Toledo株相比17株临床分离株UL148蛋白质二级结构预测结果均为第15~18位之间由α-螺旋变为β-折叠.结论17株HCMV临床低传代分离株UL148基因及其编码产物的氨基酸序列比较保守,但仍存在一定程度的多态性。
Key concepts: Human cytomegalovirus, Biology, Virology, Genetics, Gene, Polymorphism (computer science), Cytomegalovirus, Genotype