2020•《分子植物育种》印刷版Requires access
基于全基因组的番茄 YUCCA 基因家族生物信息学分析
莫福磊, Sup 莫福磊, 束艺, Sup 束艺, 陈秀玲, Sup 陈秀玲, 刘卓凡, Sup 刘卓凡, 孙妍, Sup 孙妍, 姜珊, Sup 姜珊, 李凤硕, Sup 李凤硕, 王傲雪, Sup 王傲雪
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Abstract
YUCCA 基因是植物在合成生长素过程中限速酶的编码基因，植物在生长发育过程中离不开生长素，也同样也离不开 YUCCA 基因。为深入研究番茄中的 YUCCA 基因，本研究利用生物信息学方法，在番茄全基因组范围内共鉴定出了 17 个 YUCCA 基因，并对 17 个 YUCCA 基因的基本信息、转录本结构、保守基序、顺式元件、染色体定位、系统发育以及表达模式进行了分析。结果表明， 17 个 YUCCA 基因分布在 7 条染色体上，并且可以分为三大类 A 、 B 、 C 。 YUCCA 基因的内含子在 0~7 之间分布。系统发育分析表明，同一条染色体上的 YUCCA 基因有明显的进化关系。通过以上分析，对后续深入研究番茄 YUCCA 基因家族提供了参考。