A rapid molecular taxonomy technique on the bacteria genus and species by 16S rDNA and 16S-23S rDNA intergenic spacer regions sequences
鲁辛辛, 黄艳飞, 田晓波
Abstract
鲁辛辛, 黄艳飞, 田晓波
Abstract
目的 研究细菌rDNA快速鉴定方法.方法以细菌16S rDNA、16S-23S rDNA基因间隔区(ISR)和常见细菌耐药基因为对象,通过改进标本中细菌DNA提取方法,指纹分析、直接测序与多重聚合酶链反应(PCR)技术,建立快速细菌分子鉴定方法.结果细菌属种不同表现出独特的16S-23S rDNA ISR指纹,在分析软件指导下进行初步细菌鉴定和亲缘关系研究;16S rDNA和16S-23SrDNA ISR序列可确定细菌种与型;序列分析与生化鉴定一致.多重PCR可解决葡萄球菌16S rDNA与mecA基因、产超广谱β内酰胺酶菌16S rDNA与TEM和SHV基因同步检测.结论细菌rDNA分类方法,提高了非培养细菌的鉴定能力。
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目的 研究细菌rDNA快速鉴定方法.方法以细菌16S rDNA、16S-23S rDNA基因间隔区(ISR)和常见细菌耐药基因为对象,通过改进标本中细菌DNA提取方法,指纹分析、直接测序与多重聚合酶链反应(PCR)技术,建立快速细菌分子鉴定方法.结果细菌属种不同表现出独特的16S-23S rDNA ISR指纹,在分析软件指导下进行初步细菌鉴定和亲缘关系研究;16S rDNA和16S-23SrDNA ISR序列可确定细菌种与型;序列分析与生化鉴定一致.多重PCR可解决葡萄球菌16S rDNA与mecA基因、产超广谱β内酰胺酶菌16S rDNA与TEM和SHV基因同步检测.结论细菌rDNA分类方法,提高了非培养细菌的鉴定能力。
Key concepts: 16S ribosomal RNA, Biology, Taxonomy (biology), Intergenic region, Ribosomal DNA, Ribosomal RNA, Bacteria, Genetics