Molecular genetic characteristics of F-43 UGSKHA Aeromonas hydrophila bacteriophage

Насибуллин Ильдар Равильевич, соискатель кафедры «Микробиология, вирусология, эпизоотология и ветеринарно-санитарная экспертиза» Мастиленко Андрей Владимирович, кандидат биологических наук, доцент кафедры «Микробиология, вирусология, эпизоотология и ветеринарно-санитарная экспертиза» Нафеев Александр Анатольевич, доктор биологических наук, профессор кафедры «Микробиология, вирусология, эпизоотология и ветеринарно-санитарная экспертиза» ФГБОУ ВО Ульяновский ГАУ 432017, г.Ульяновск, бульвар Новый Венец, дом 1; 8(8422)55-95-47 Nir72@mail.ruКлючевые слова: Aeromonas hydrophila, бактериофаг, белок, молекулярная масса, протеом, секвенирование.Насчитывающая более 100 лет история изучения бактерий рода Aeromonas активно продолжается и в наши дни.В статье представлена молекулярно-генетическая характеристика бактериофага Aeromonas hydrophila F-43 УГСХА.В ходе работы проведено полногеномное секвенирование бактериофага для определения наличия потенциальных генетических локусов патогенности и установлено, что размер исследуемого бактериофагового генома составляет -36801 п.н.и потенциальных локусов патогенности не выявлено.По результатам биоинформационного (протеомного) анализа по данным секвенирования бактериофага F43-УГСХА выявлено 46 потенциальных белков с молекулярной массой 4,6-137,6 кДа, имеющих свое место локализации в фаговом геноме.Определено филогенетическое положение бактериофага F43-УГСХА в группе аннотированных в системе NCBI -наиболее близким по филогенетическому положению полного генома и большинства потенциальных фаговых белков является анотированный бактериофаг Aeh1, активный в отношении бактерий Aeromonas hydrophila.В результате проведенных исследований была составлена карта линейной ДНК бактериофага.В соответствии с известными аналогами были определены продукты экспрессии генов.Также выявлены продукты генов, не имеющие четко определенных функциональных характеристик, так называемые гипотетические белки, не имеющие аналогии в аннотированных геномах бактериофагов, активных в отношении изучаемого бактериального вида.Представлен биоинформационный анализ соответствия открытых рамок считывания (ORF) с данными секвенирования изучаемого бактериофага.По результатам исследований в геноме бактериофага F-43 УГСХА Aeromonas hydrophila локусов патогенности не выявлено.