2005Zhonghua jianyan yixue zazhiRequires access

Application of 23S rRNA gene in identification of common pathogens

林东昉, 徐晓刚, 朱德妹, 汪复, 张婴元

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Abstract

目的 建立基于23S rRNA基因的一种常见病原菌菌种鉴定的分子生物学方法. 方法使用地高辛标记的通用引物扩增常见病原菌的23S rRNA基因,并在尼龙膜上固定根据扩增产物序列设计的菌种特异性探针,根据反向杂交结果判断病原菌种类.选取临床分离获得的菌株验证该方法的有效性.结果通用引物可特异性扩增细菌23S rRNA.应用该方法可鉴定金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、奇异变形杆菌、阴沟肠杆菌、鲍曼不动杆菌、绿脓假单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌和洋葱伯克霍尔德菌.检测临床标本结果显示,与常规培养方法的符合率为99%.结论该方法可用于常见病原菌的鉴定。

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目的 建立基于23S rRNA基因的一种常见病原菌菌种鉴定的分子生物学方法. 方法使用地高辛标记的通用引物扩增常见病原菌的23S rRNA基因,并在尼龙膜上固定根据扩增产物序列设计的菌种特异性探针,根据反向杂交结果判断病原菌种类.选取临床分离获得的菌株验证该方法的有效性.结果通用引物可特异性扩增细菌23S rRNA.应用该方法可鉴定金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、奇异变形杆菌、阴沟肠杆菌、鲍曼不动杆菌、绿脓假单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌和洋葱伯克霍尔德菌.检测临床标本结果显示,与常规培养方法的符合率为99%.结论该方法可用于常见病原菌的鉴定。

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Method / approach

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Limitations

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Applications

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目的 建立基于23S rRNA基因的一种常见病原菌菌种鉴定的分子生物学方法. 方法使用地高辛标记的通用引物扩增常见病原菌的23S rRNA基因,并在尼龙膜上固定根据扩增产物序列设计的菌种特异性探针,根据反向杂交结果判断病原菌种类.选取临床分离获得的菌株验证该方法的有效性.结果通用引物可特异性扩增细菌23S rRNA.应用该方法可鉴定金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、奇异变形杆菌、阴沟肠杆菌、鲍曼不动杆菌、绿脓假单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌和洋葱伯克霍尔德菌.检测临床标本结果显示,与常规培养方法的符合率为99%.结论该方法可用于常见病原菌的鉴定。

Key concepts: 23S ribosomal RNA, Identification (biology), Ribosomal RNA, Microbiology, Biology, Computational biology, Gene, Genetics

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