Application of 23S rRNA gene in identification of common pathogens
林东昉, 徐晓刚, 朱德妹, 汪复, 张婴元
Abstract
林东昉, 徐晓刚, 朱德妹, 汪复, 张婴元
Abstract
目的 建立基于23S rRNA基因的一种常见病原菌菌种鉴定的分子生物学方法. 方法使用地高辛标记的通用引物扩增常见病原菌的23S rRNA基因,并在尼龙膜上固定根据扩增产物序列设计的菌种特异性探针,根据反向杂交结果判断病原菌种类.选取临床分离获得的菌株验证该方法的有效性.结果通用引物可特异性扩增细菌23S rRNA.应用该方法可鉴定金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、奇异变形杆菌、阴沟肠杆菌、鲍曼不动杆菌、绿脓假单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌和洋葱伯克霍尔德菌.检测临床标本结果显示,与常规培养方法的符合率为99%.结论该方法可用于常见病原菌的鉴定。
A significance statement is not available in the OpenAlex record.
A contribution statement is not available in the OpenAlex record.
Method details are not available in the OpenAlex metadata.
Findings are not separately available in the OpenAlex metadata.
Limitations are not available in the OpenAlex metadata.
Application details are not available in the OpenAlex metadata.
目的 建立基于23S rRNA基因的一种常见病原菌菌种鉴定的分子生物学方法. 方法使用地高辛标记的通用引物扩增常见病原菌的23S rRNA基因,并在尼龙膜上固定根据扩增产物序列设计的菌种特异性探针,根据反向杂交结果判断病原菌种类.选取临床分离获得的菌株验证该方法的有效性.结果通用引物可特异性扩增细菌23S rRNA.应用该方法可鉴定金黄色葡萄球菌、凝固酶阴性葡萄球菌、粪肠球菌、屎肠球菌、肺炎链球菌、大肠埃希菌、肺炎克雷伯菌、奇异变形杆菌、阴沟肠杆菌、鲍曼不动杆菌、绿脓假单胞菌、嗜麦芽窄食单胞菌和洋葱伯克霍尔德菌.检测临床标本结果显示,与常规培养方法的符合率为99%.结论该方法可用于常见病原菌的鉴定。
Key concepts: 23S ribosomal RNA, Identification (biology), Ribosomal RNA, Microbiology, Biology, Computational biology, Gene, Genetics