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Etude des mécanismes d'assemblage co-traductionnel des complexes protéiques impliqués dans la transcription dans les cellules de mammifère

Pooja Mukherjee

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Abstract

La majorité des processus biologiques sont réalisés par des complexes protéiques multisubunités dans les cellules et une quantité importante d'énergie est requise par les cellules pour construire ces énormes complexes. Contrairement aux bactéries, les gènes codant pour les protéines sont dispersés dans le génome des eucaryotes, ce qui complique la compréhension de l'assemblage des complexes protéiques. En utilisant l'immunoprécipitation d'ARN suivie par la détection des ARNm à l'échelle du génome par analyse par micropuce, ARN molécule unique, FISH, immunofluorescence, cellules souches embryonnaires knock-out de souris et approches de permutation de domaines, nous montrons que les complexes de transcription multisubunit de mammifère s'assemblent de manière co-traductionnelle. Nous démontrons que les domaines de dimérisation et leurs positions dans les sous-unités en interaction déterminent la voie d'assemblage de co-traduction (simultanée ou séquentielle). En outre, les expériences cytoplasmiques IF-smFISH et bicolores smFISH indiquent que l'assemblage de co-traduction décrit se produit clairement dans le cytoplasme de cellules humaines. Des résultats identiques dans les cellules de levure, de souris et humaine suggèrent que l'assemblage par co-traduction est un mécanisme général chez les eucaryotes, qui pourrait être nécessaire pour éviter les interactions non spécifiques et l'agrégation de protéines dans la cellule.

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What this paper is about

La majorité des processus biologiques sont réalisés par des complexes protéiques multisubunités dans les cellules et une quantité importante d'énergie est requise par les cellules pour construire ces énormes complexes. Contrairement aux bactéries, les gènes codant pour les protéines sont dispersés dans le génome des eucaryotes, ce qui complique la compréhension de l'assemblage des complexes protéiques. En utilisant l'immunoprécipitation d'ARN suivie par la détection des ARNm à l'échelle du génome par analyse par micropuce, ARN molécule unique, FISH, immunofluorescence, cellules souches embryonnaires knock-out de souris et approches de permutation de domaines, nous montrons que les complexes de transcription multisubunit de mammifère s'assemblent de manière co-traductionnelle. Nous démontrons que les domaines de dimérisation et leurs positions dans les sous-unités en interaction déterminent la voie d'assemblage de co-traduction (simultanée ou séquentielle). En outre, les expériences cytoplasmiques IF-smFISH et bicolores smFISH indiquent que l'assemblage de co-traduction décrit se produit clairement dans le cytoplasme de cellules humaines. Des résultats identiques dans les cellules de levure, de souris et humaine suggèrent que l'assemblage par co-traduction est un mécanisme général chez les eucaryotes, qui pourrait être nécessaire pour éviter les interactions non spécifiques et l'agrégation de protéines dans la cellule.

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Key contribution

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Method / approach

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Main findings

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Limitations

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Applications

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Available abstract

La majorité des processus biologiques sont réalisés par des complexes protéiques multisubunités dans les cellules et une quantité importante d'énergie est requise par les cellules pour construire ces énormes complexes. Contrairement aux bactéries, les gènes codant pour les protéines sont dispersés dans le génome des eucaryotes, ce qui complique la compréhension de l'assemblage des complexes protéiques. En utilisant l'immunoprécipitation d'ARN suivie par la détection des ARNm à l'échelle du génome par analyse par micropuce, ARN molécule unique, FISH, immunofluorescence, cellules souches embryonnaires knock-out de souris et approches de permutation de domaines, nous montrons que les complexes de transcription multisubunit de mammifère s'assemblent de manière co-traductionnelle. Nous démontrons que les domaines de dimérisation et leurs positions dans les sous-unités en interaction déterminent la voie d'assemblage de co-traduction (simultanée ou séquentielle). En outre, les expériences cytoplasmiques IF-smFISH et bicolores smFISH indiquent que l'assemblage de co-traduction décrit se produit clairement dans le cytoplasme de cellules humaines. Des résultats identiques dans les cellules de levure, de souris et humaine suggèrent que l'assemblage par co-traduction est un mécanisme général chez les eucaryotes, qui pourrait être nécessaire pour éviter les interactions non spécifiques et l'agrégation de protéines dans la cellule.

Key concepts: Molecular biology, Biology

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