Nested PCR 기법을 이용한 인삼 뿌리썩음병원균의 특이적 검출
장창순, Nam Keun Kim, 김선익, 송정영, 유성준, 김홍기
Abstract
장창순, Nam Keun Kim, 김선익, 송정영, 유성준, 김홍기
Abstract
Cylindrocarpon destructans는 인삼 및 수목에 뿌리썩음병을 일으키는 토양 전염성 식물병원균이다. 신속 정확한 검출 가능성을 알아보기 위하여 종 특이적인 primer와 nested PCR 기법을 활용하여 인삼 유묘로부터 뿌리썩음병균 C. destructans의 검출을 시도하였다. ITS 1과 ITS 4 primer를 이용한 1차 PCR 증폭산물에 대해 Dest 1과 Dest 4 primer로 2차 PCR 증폭을 실시한 결과 병원성이 확인된 C. destructans에서만 400 bp의 종특이적 증폭산물을 얻을 수 있었다. 종 특이적 primer와 nested PCR 기법을 이용한 인삼뿌리썩음병균 DNA에 대한 반응 민감도는 최저 약 1 fg으로 나타나 단 몇 개의 포자만 존재해도 검출이 가능하였다. 또한, nested PCR 기법은 실제 이병토양에 심었을 경우에도 C. destructans에 감염된 인삼 유묘로부터만 정확하게 병원균을 검출해 내었다. 종특이적 primer와 nested PCR 기법을 이용한 본 연구 결과는 실제 재배농가에서 인삼 경작시 뿌리썩음병 진단에 매우 유용하게 활용될 수 있을 것으로 판단된다.
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Cylindrocarpon destructans는 인삼 및 수목에 뿌리썩음병을 일으키는 토양 전염성 식물병원균이다. 신속 정확한 검출 가능성을 알아보기 위하여 종 특이적인 primer와 nested PCR 기법을 활용하여 인삼 유묘로부터 뿌리썩음병균 C. destructans의 검출을 시도하였다. ITS 1과 ITS 4 primer를 이용한 1차 PCR 증폭산물에 대해 Dest 1과 Dest 4 primer로 2차 PCR 증폭을 실시한 결과 병원성이 확인된 C. destructans에서만 400 bp의 종특이적 증폭산물을 얻을 수 있었다. 종 특이적 primer와 nested PCR 기법을 이용한 인삼뿌리썩음병균 DNA에 대한 반응 민감도는 최저 약 1 fg으로 나타나 단 몇 개의 포자만 존재해도 검출이 가능하였다. 또한, nested PCR 기법은 실제 이병토양에 심었을 경우에도 C. destructans에 감염된 인삼 유묘로부터만 정확하게 병원균을 검출해 내었다. 종특이적 primer와 nested PCR 기법을 이용한 본 연구 결과는 실제 재배농가에서 인삼 경작시 뿌리썩음병 진단에 매우 유용하게 활용될 수 있을 것으로 판단된다.
Key concepts: Primer (cosmetics), Nested polymerase chain reaction, Biology, Polymerase chain reaction, Genetics, Chemistry, Gene, Organic chemistry