2018•Nihon Chikusan GakkaihoOpen access
Genetic structure and relationships among 11 cattle populations using indel markers
Hayate Yamanaka, Shinji Sasazaki, Hla Hla Moe, Moe Lwin, Takeshi Shimogiri, Hideyuki MANNNEN
Open full text 1 citations
Abstract
本研究では家畜ウシにおけるIndelマーカーの開発を試み，家畜ウシ集団に対する遺伝的構造や類縁関係，遺伝的多様性の調査を目的とした．各常染色体から29 Indelを選出し遺伝子型判定を実施した結果，26 IndelにおいてPCR増幅と多型が認められた．そのうち8 Indelマーカーを選択し，家畜ウシ11集団を用いた解析を実施した．多様性指標の結果では，Bos taurusよりもBos indicusの方が低い値を示した．系統樹や主成分分析の結果では，2亜種で系統が明確に分離した．STRUCTURE解析では，K＝4のとき最尤推定値を示し，K≧5ではカザフスタンとモンゴル在来牛が，複数の祖先系統に由来する遺伝構造を形成していた．以上より，開発したIndelマーカーを用いた本研究結果では，地域や気候，亜種や品種に基づいた結果が得られ，ウシにおけるIndelマーカーの有効性が示された．
Open-access reader