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Variation in spacer ribosornal DNA in sorne cyst-forming species of plant parasitic nernatodes

V. R. Ferris, J. M. Ferris, J. Faghihi

Open publisher page 207 citations

Abstract

Summary- Partial sequences from internal transcribed spacer ribosomal DNA (ITS rDNA) obtained by polymerase chain reaction (PCR) from isolates of plant parasitic cyst nematodes, were compared with the published sequenœ for Caenorhabditis elegans and with each other. Data were from ITS 1 and ITS2 of the rDNA array, and included also parts of the 18S and 28S genes adjacent to the spacer regions. The ITS data for cyst nematodes \\Vere highly dissimiJar to those for C. elegans. The sequences for five geographic isolares of Helerodera glycines \\Vere very similar to each other, but showed nearly as many differences as were evident between this species and either H. schachlii or H. lriJolii. More differences were observed in H. carolae, and many more in H. avenae. The findings confirm the utiliry of gene and spacer region rDNA for systematic inference among species and genera of cyst nematodes. Résumé- Variabilité des régions intergéniques de l'ADN ribosornal des espèces de nématodes à kystes parasites des plantes- Des séquences partielles des régions intergéniques transcrites de ['ADN ribosomal (ITS rDNA) de souches de nématodes à kystes parasites de plantes ont été obtenues par une réaction de polymérisation en chaîne (PCR), puis comparées entre elles et avec les séquences publiées de Caenorhabditis elegans. Les données ont été obtenues des ITS 1 et ITS2 du rDNA, mais elles incluaient également des parties des gènes I8S et 26S, adjacents aux régions intergéniques. Les données sur les ITS des nématodes à kystes sont très différentes de ceUes de C. elegans. Les séquences de cinq souches de Heterodera glycines provenant de régions différentes sont trés proches les unes des autres, mais montrent à peu près autant de différences entre elles qu'avec H. schachlii ou avec H. mfolii. Il a été observé des différences plus prononcées avec H. carolae, et encore plus avec H. avenae. Ces résultats confirment l'utilité des gènes, et des régions intergéniques du rDNA, pour l'érude des relations systématiques entre espèces et genres du groupe de nématodes à kystes.

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Summary- Partial sequences from internal transcribed spacer ribosomal DNA (ITS rDNA) obtained by polymerase chain reaction (PCR) from isolates of plant parasitic cyst nematodes, were compared with the published sequenœ for Caenorhabditis elegans and with each other. Data were from ITS 1 and ITS2 of the rDNA array, and included also parts of the 18S and 28S genes adjacent to the spacer regions. The ITS data for cyst nematodes \\Vere highly dissimiJar to those for C. elegans. The sequences for five geographic isolares of Helerodera glycines \\Vere very similar to each other, but showed nearly as many differences as were evident between this species and either H. schachlii or H. lriJolii. More differences were observed in H. carolae, and many more in H. avenae. The findings confirm the utiliry of gene and spacer region rDNA for systematic inference among species and genera of cyst nematodes. Résumé- Variabilité des régions intergéniques de l'ADN ribosornal des espèces de nématodes à kystes parasites des plantes- Des séquences partielles des régions intergéniques transcrites de ['ADN ribosomal (ITS rDNA) de souches de nématodes à kystes parasites de plantes ont été obtenues par une réaction de polymérisation en chaîne (PCR), puis comparées entre elles et avec les séquences publiées de Caenorhabditis elegans. Les données ont été obtenues des ITS 1 et ITS2 du rDNA, mais elles incluaient également des parties des gènes I8S et 26S, adjacents aux régions intergéniques. Les données sur les ITS des nématodes à kystes sont très différentes de ceUes de C. elegans. Les séquences de cinq souches de Heterodera glycines provenant de régions différentes sont trés proches les unes des autres, mais montrent à peu près autant de différences entre elles qu'avec H. schachlii ou avec H. mfolii. Il a été observé des différences plus prononcées avec H. carolae, et encore plus avec H. avenae. Ces résultats confirment l'utilité des gènes, et des régions intergéniques du rDNA, pour l'érude des relations systématiques entre espèces et genres du groupe de nématodes à kystes.

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Summary- Partial sequences from internal transcribed spacer ribosomal DNA (ITS rDNA) obtained by polymerase chain reaction (PCR) from isolates of plant parasitic cyst nematodes, were compared with the published sequenœ for Caenorhabditis elegans and with each other. Data were from ITS 1 and ITS2 of the rDNA array, and included also parts of the 18S and 28S genes adjacent to the spacer regions. The ITS data for cyst nematodes \\Vere highly dissimiJar to those for C. elegans. The sequences for five geographic isolares of Helerodera glycines \\Vere very similar to each other, but showed nearly as many differences as were evident between this species and either H. schachlii or H. lriJolii. More differences were observed in H. carolae, and many more in H. avenae. The findings confirm the utiliry of gene and spacer region rDNA for systematic inference among species and genera of cyst nematodes. Résumé- Variabilité des régions intergéniques de l'ADN ribosornal des espèces de nématodes à kystes parasites des plantes- Des séquences partielles des régions intergéniques transcrites de ['ADN ribosomal (ITS rDNA) de souches de nématodes à kystes parasites de plantes ont été obtenues par une réaction de polymérisation en chaîne (PCR), puis comparées entre elles et avec les séquences publiées de Caenorhabditis elegans. Les données ont été obtenues des ITS 1 et ITS2 du rDNA, mais elles incluaient également des parties des gènes I8S et 26S, adjacents aux régions intergéniques. Les données sur les ITS des nématodes à kystes sont très différentes de ceUes de C. elegans. Les séquences de cinq souches de Heterodera glycines provenant de régions différentes sont trés proches les unes des autres, mais montrent à peu près autant de différences entre elles qu'avec H. schachlii ou avec H. mfolii. Il a été observé des différences plus prononcées avec H. carolae, et encore plus avec H. avenae. Ces résultats confirment l'utilité des gènes, et des régions intergéniques du rDNA, pour l'érude des relations systématiques entre espèces et genres du groupe de nématodes à kystes.

Key concepts: Biology, Ribosomal DNA, Internal transcribed spacer, Ribosomal RNA, Polymerase chain reaction, Gene, Molecular biology, Genetics

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